Поява чорної легенди в історії інквізиції може бути пояснена кількома факторами. По-перше, сама інквізиція була часто використовувана для політичних цілей та зміцнення влади католицької церкви. Жорстокі методи, які використовувалися інквізиторами, такі як пытки та масові вбивства, сприяли формуванню негативного ставлення до церкви та поширенню чорної легенди.

Оцінка інквізиції як методу, за допомогою якого католицька церква зміцнювала свій авторитет, є суперечливою. З одного боку, інквізиція допомагала церкві зберегти свою єдність та боротися з геретичними рухами, що могли загрожувати її авторитету. З іншого боку, методи, які використовувалися інквізиторами, були жорстокими та порушували права людини, що спричиняло обурення та негативне ставлення до церкви. Оцінка інквізиції залежить від поглядів та цінностей кожної людини.