У плаунов, в отличие от мхов, развит корень, есть механические и проводящие ткани, в жизненном цикле бесполое поколение (спорофит) преобладает над гаметофитом, оба поколения живут раздельно.

Плауны отличаются от мхов хорошей водопроводящей или сосудистой тканью.