У плоских червів, на відміну від ще простіших організмів, з'явилась видільна система, яка побудована по типу протонефридіїв. Якщо детальніше, то це розгалужена система канальців, яка починається в паренхімі зірчастими клітинами з пучком війок і закінчується видільними отворами або порами. Завдяки такій будові видільної системи рідкі, уже "спожиті" продукти обміну речовин виділяються із організму назовні.