Чернила были красные и черные. Весь текст писался чернилами черного цвета, а начало  каждого нового раздела, т.е. новой мысли выделяли красными чернилами, так появилось выражение "красная строка", которым мы и сейчас обозначаем новую строку в начале абзаца.