химическую связь между положительно поляризованными атомами водорода одной молекулы (или ее части) и отрицательно поляризованными атомами сильно электроотрицательных элементов, имеющих неполноценные электронные пары (F, O, N и реже Cl S) другой молекулы(или его части), называют водородной.

примерами такой связи могут быть спирты, вода, в биополимерах-белках между карбонильным кислородом и водородом аминогруппы.

при наличии такой связи даже низкомолекулярные вещества могут быть при обычных условиях жидкостями или легко сжижающимися газами(аммиак, фтороводород). вещества с водородной связью имеют молекулярные кристаллические решетки.