Гипоталамус является частью промежуточного мозга. Он образует основание и стены нижней части третьего желудочка.

Таламус выполняет несколько важных физиологических функций. Он отвечает за передачу сенсорной и двигательной информации от органов чувств (кроме информации от органов обоняния) к соответствующим областям коры больших полушарий млекопитающих или плаща мозга низших хордовых.

Таламус играет важную роль в регуляции уровня сознания, процессов сна и бодрствования, концентрации внимания.