прокариотические клетки проще. их ДНК не связана в хромосомы и не окружена ядерной оболочкой.
у эукариотов все сложнее, их ДНК , связанная с белком , организована в хромосомы , которые располагаются в особом образовании, по сути самом крупном органоиде клетки - ядре.

по размеру тоже отличаются: эукариотические клетки больше прокариотических.

прокариотические клетки могут делиться на равные части перетяжкой или почковаться и никогда не делятся митозом, а эукариотические напротив делятся лишь митозом.
Прокариотической клетке в процессе обмена веществ не требуется аскорбиновая кислота , но эукариотические не могут без нее обходиться.