let str = "отец,мать";

   let new_str = "";

   for(let i = 0;i<str.length;i++){

     if(str[i] == 'о'||str[i] == ','){

       new_str+= 'а';

     }else{

       new_str+=str[i];

     }

   }

console.log(new_str);

С отступами всё плохо, прикреплю файл