Сенат- аристократический орган, а Боярская дума-сословный.

Боярская дума стала продолжением княжеской думы и без думы не обходился ни один государь.Боярская дума не была самостоятельной, она всегда совещалась  с царем, составляя с ним совместную власть. 

Правительствующий Сенат в РИ(российской империи)  был высшим гос. органом , котю был подчинен императору. Учредил его Петр I в 1711 году, сделав его высшим органом власти и всего законодательства в целом.