При растворении в воде аминогруппа и карбоксильная гpуппа в молекулах аминокислот взаимодействуют между собой с образованием биполярного иона (внутренней соли), например.

Водные растворы большинства аминокислот имеют нейтральную среду. Индикаторы не изменяют окраску, т.к. действие на индикатор одной функциональной гpуппы нейтрализуется противоположным действием другой гpуппы. Однако в том случае, если в составе молекулы две карбоксильные гpуппы и одна аминогруппа, среда будет кислой (например, в растворах глутаминовой и аспарагиновой кислот), и наоборот, будет щелочной в случае двух аминогрупп и одной карбоксильной гpуппы (например, в растворе лизина).