узкая и неглубокая река Цемесс.В 14 км от Новороссийска находится самое большое пресноводное озеро Краснодарского края Абрау.В юго-восточной части города находится озеро Солёное,Оно примечательно тем, что от моря его отделяет узкая полоса Суджукской косы.