Корень: -тр-; интерфикс: -и-; корень: -ст-; окончание: -а [Тихонов, 1996].

Если попробовать подставить это слово в разные падежи, то:

падеж форма

Им. три́ста

Р. трёхсо́т

Д. трёмста́м

В. три́ста

Тв. тремяста́ми

Пр. трёхста́х

Подчеркиваю, изменяется окончание после суффикса -ст.

Соответственно, окончание - ах