1. Солнце садилось в травы, туманы и росы, и шум поезда не мог заглушить птичьего гомона и  перелива в кустах железнодорожного полотна.

В травы, туманы - однородные члены предложения

Запятая перед "и шум поезда" ставится, так как это сложносочиненное предложение

2. Стремление человека к приобретению знаний естественно и полезно как для самого  приобретателя, так и для всего общества.

Запятая перед "так и" ставится, так как союз как ... так и соединяет однородные члены

3. Философская проблематика «Преступления и наказания» Ф.М. Достоевского вобрала в себя сложные социальные и идейно-нравственные вопросы и потребовала от писателя глубокогопсихологизма.

Запятые не требуются

4. С вершины пологого холма передо мною то золотым, то посеребрённым морем пестрела  спелая рожь.

Запятая перед "то посеребренным" ставится, так как союз то ... то соединяет однородные члены

5. На столе, и на подоконнике, и на комоде лежали книги.

Запятые ставятся при повторяющихся сочинительных союзах между однородными членами предложения (на столе, на подоконнике, на комоде)

Ответ: 2, 4